qPCR gebruiken om contamination te zien

qPCR is een zeer gevoelige en specifieke methode die gericht is op het amplificeren en kwantificeren van DNA-sequenties. Hierdoor kan het bijvoorbeeld microbiële contaminanten in schimmelculturen onderscheiden en kwantificeren, zelfs als deze in lage concentraties aanwezig zijn. Veel studies en toepassingen tonen aan dat qPCR succesvol wordt ingezet om specifieke schimmel- en bacteriesoorten die contaminatie veroorzaken te identificeren, bijvoorbeeld door het richten op soortspecifieke DNA-markers.

Belangrijke punten:

  • qPCR kan onderscheid maken tussen het DNA van het gecultiveerde mycelium en dat van contaminanten, mits geschikte primers en probes worden gebruikt.
  • De techniek is zeer gevoelig en kan ook lage niveaus van contaminanten detecteren.
  • Vaak worden multiplex qPCR-assays gebruikt waarmee meerdere soorten contaminanten tegelijk kunnen worden opgespoord.
  • qPCR wordt gebruikt in kwaliteitscontrole in de productie van schimmels, paddenstoelen en biotechnologische culturen.